Генетика в облаке: как «ЛабКвест-Генетика» оперативно проводит генетические исследования в рамках пренатальной диагностики
Автомасштабирование Kubernetes для обработки генетических данных: как «ЛабКвест-Генетика» обеспечила бесперебойный анализ генетических данных эмбрионов в облаке Cloud.ru
Результат
О компании
АО «ЛабКвест-Генетика» — молекулярно-генетическая лаборатория медицинской компании «ЛабКвест», которая с августа 2024 года проводит передовые генетические исследования в одном из крупных инновационно-технологических медицинских кластеров Москвы.
Лаборатория площадью 800 кв.м располагает располагает командой опытных врачей-генетиков, биоинформатиков и молекулярных биологов, а также собственным парком секвенаторов NGS. Производственные мощности лаборатории позволяют в самые короткие сроки проводить исследования:
- НИПТ — неинвазивные пренатальные тесты для беременных женщин, позволяющие выявить риски хромосомных аномалий плода;
- ПГТ — преимплантационные генетические тестирования эмбрионов на хромосомные нарушения и наследственные заболевания для женщин в программе ЭКО.
Задача
В 2024 году совместно с ООО «НПФ ДНК-Технология» лаборатория «ЛабКвест-Генетика» запустила направление генетических исследований, которое предполагает хранение и обработку большого массива данных с помощью СекВарио Платформа» — софта для анализа данных высокопроизводительного секвенирования (NGS).
Когда бизнес только запускается, непросто понять, какой объем заказов в день будет поступать и сколько ресурсов потребуется на их обработку. Поэтому при выборе между развертыванием в облаке и on-premise, мы предпочли облако — в нем куда проще настраивать потребление под задачи бизнеса.
Мы секвенируем биоматериал наших клиентов с помощью специальных лабораторных машин и сохраняем результаты секвенирования в локальной инфраструктуре. Затем полученные данные загружаем в облако, где ведется их преобразование и анализ, это происходит пару раз в неделю. В этот момент возникают значительные всплески нагрузки на вычислительные ресурсы.
Было решено развернуть инфраструктуру в облаке, чтобы гибко масштабировать ее под текущую нагрузку и обеспечивать высокую скорость обработки данных.
Почему Cloud․ru
Проанализировав предложения нескольких провайдеров, компания остановила свой выбор на Cloud.ru. Наиболее ценными преимуществами для «ЛабКвест» стали стабильность инфраструктуры и возможность автоматического масштабирования ресурсов, с помощью которой можно значительно сэкономить, добавляя ресурсы на момент исследования и высвобождая их после.
Для нас критически важна непрерывность процессов, ведь мы работаем с крайне чувствительной аудиторией: наши клиенты — это беременные женщины или женщины в программе ЭКО. Для них одинаково ценен как точный результат исследования, так и скорость его получения. Ведь результаты тестов часто нужны клиентам к определенной дате, например, к приему у врача.
Решение
Компания разместила инфраструктуру на высокопроизводительных кластерах Kubernetes в сервисе Advanced Cloud Container Engine c функцией автоматического масштабирования, которая позволяет отслеживать нагрузку на узлы и при необходимости уменьшает или увеличивает их количество в заданных лимитах.
Для размещения классических приложений «ЛабКвест» использует виртуальные машинывиртуальные машины платформы Cloud.ru Advanced. Также компания настроила резервное копирование в облаке.
Результат
Благодаря Cloud.ru лаборатория «ЛабКвест-Генетика» смогла организовать стабильную и экономичную инфраструктуру для исследований: большие объемы данных обрабатываются непрерывно, а автоматическое масштабирование помогает сокращать расходы на инфраструктуру в периоды низкой нагрузки.
Для меня основной плюс облака Cloud.ru — это непрерывность процессов. Наша лаборатория работает 365 дней в году 24/7. У нас нет выходных. У нас нет перерыва на ночь. И даже в Новый год, под бой курантов, мы тоже работаем. И, размещая нашу инфраструктуру в облаке, мы всегда уверены, что процесс обработки данных не встанет, ведь в облаке ресурсы масштабируются автоматически, без моего участия.
Планы
В дальнейшем компания планирует расширить спектр услуг лаборатории «ЛабКвест Генетика» — запустить направление «онкогенетика», которое позволит выполнять полный спектр современных молекулярно-генетических исследований для онкологических пациентов, а также проводить полноэкзомное секвенирование* для диагностики различных заболеваний. Поэтому «ЛабКвест» намерена масштабировать ресурсы на платформе Cloud.ru Advanced по мере развития текущих направлений и появления будущих.
Мы наблюдаем уверенный рост спроса на наши услуги: только за последние полгода объем заказов удвоился. В перспективе следующих двух лет мы планируем увеличить текущие показатели как минимум вчетверо.
Мы ценим доверие, которое демонстрирует нам команда «ЛабКвест Генетика». Рады предоставлять облачные сервисы, которые помогают бизнесу сокращать time to market и быстро выводить на рынок такие важные услуги, как генетические исследования для будущих мам.*Полноэкзомное секвенирование — это метод генетического анализа, позволяющий прочитать все белоккодирующие участки генома (экзон), где содержится около 20 000 генов.
Запросите бесплатную консультацию по вашему проекту
